解锁指挥官功能，首先需要完成主线任务第二场梦。这个系列任务会引导你逐步了解指挥官的背景故事，并在最后解锁指挥官的控制权。完成第二场梦后，按键盘数字键5就能切换出指挥官。不过这时候的指挥官功能还比较基础，只能进行简单的移动和跳跃。
让指挥官获得更多能力，需要继续推进主线任务内战。完成这个任务后，指挥官会解锁额外的技能，并且可以通过专精系统来强化不同流派的能力。专精系统在飞船的传识之间里设置，活体连接器装置可以查看和调整专精流派。建议优先选择能回蓝的流派，对新手期的帮助比较大。
指挥官在部分特殊任务中会发挥关键作用，比如面对某些特定敌人时，只有指挥官的攻击才能造成有效伤害。这时候要灵活切换战甲和指挥官，先用指挥官破除敌人的特殊护盾，再换回战甲输出。增幅器的选择也很重要，233搭配是比较通用的配置，能应对大多数情况。
在殁世幽都这类特殊地图中，快速移动功能对指挥官和战甲有不同效果。使用指挥官快速移动会直接传送到目标点，而战甲快速移动只会到目标点门口。如果想找LOID这类NPC，记得用指挥官传送会更方便。指挥官的外观可以在传识之间自定义，靠近后按X键就能进入设置界面。指挥官系统是游戏中的重要玩法，随着进度推进会越来越强大。平时多练习切换时机和技能搭配，后期的高难度任务会轻松很多。
