司马盾阵容以其强大的防御能力和后期输出著称，但它在面对某些特定类型的攻击时显得尤为脆弱。该阵容的核心依赖于司马懿的指挥战法进行持续伤害，同时通过藤甲兵等减伤手段维持生存，然而这种设计也带来了明显的弱点。玩家需要了解这些弱点以避免在战斗中处于不利地位，尤其是在阵容搭配和对手选择上需格外谨慎。
司马盾对火系伤害的抵抗能力极差，这主要是由于其常用的藤甲兵兵种特性所致。藤甲兵虽然能大幅降低受到的兵刃伤害，但会使队伍更容易受到灼烧效果的影响，导致额外兵力损失。当对手携带如火炽原燎等火系战法，或拥有自带火攻技能的武将时，司马盾的防御体系会迅速瓦解，造成严重的战损甚至失败。这种弱点使得阵容在面对以火攻为主的队伍时往往处于被动，需要提前调整战术或更换兵种来规避风险。
另一个关键弱点是当锋摧决这类战法，它能暂时禁用指挥和被动战法，直接针对司马盾的核心输出机制。司马懿的用武通神和士别三日等主要伤害来源都属于指挥战法，一旦被伪报效果命中，就无法在当回合发挥作用，大幅降低了队伍的威胁。这使得司马盾在面对携带当锋摧决的队伍时，输出能力大打折扣，难以在后期积累优势，甚至可能因无法及时反击而落败。
司马盾的节奏偏慢，需要时间让司马懿的伤害叠加，因此对速攻和高爆发队伍缺乏有效的应对手段。像爆头骑等物理爆发阵容可以在前几回合通过快速兵力削减打破司马盾的防御，使其无法撑到中后期发挥实力。这些队伍通常依靠先手优势和连续攻击，能迅速压低收入方血量，导致司马盾在开局阶段就陷入被动，难以扭转战局。
