仙舟区域包含多个隐藏任务，这些任务通常没有明确提示，需要通过与特定NPC对话或调查环境中的可交互物品触发。其中倒霉的阿幸任务流程较为典型：在星槎海中枢的小吃摊附近，先与小女孩对话选择确实羞耻，再与旁边男子交谈并选择三七分或四六分假赛协议。比赛环节需按吃→吃→有多少喝多少→吃不下了的顺序选择，若此前未完成对话则可能触发不同结局并获得成就上兵伐谋或师出有名。
另一隐藏任务忧郁的机巧鸟需在星槎海中枢桥边与机巧鸟对话开启。第一只鸟藏在正对大门的位置，完成捉迷藏后触发后续；第二只鸟需按1、3、2的顺序回答对话问题；第三只鸟位于一群孩童围绕的大壮处，选择第二个选项即可完成。该任务链涉及多阶段解谜，需注意对话选项的连贯性。
鲛人泪任务线起始于赎珠坊，调查柜台上的脏兮兮的零件后交给附近念叨复仇的年轻人，换取陈旧的铁盒。随后前往长乐天三余书肆，用铁盒交换鲛人泪，最后将道具交给星槎海中枢的霍华德。任务全程需通过NPC对话线索推进，且涉及道具传递逻辑。
部分隐藏任务与场景互动相关，例如在司辰宫调查岩明背后的发光点，需先触发调查再通过调虎离山策略开启宝箱；长乐天的罐中仙需提交5个垃圾道具换取奖励，次日还可再次交互获取额外巡镝。此类任务强调环境细节观察与时间机制的结合。
