开启宝箱是获取资源、装备和文物的关键环节，但部分宝箱因位置隐蔽或机关复杂容易让玩家卡关。宝箱主要分为普通锁箱、环境解谜箱和水下宝箱三类，其中普通锁箱需要开锁器工具，该工具需在游戏推进至隐秘之城后从隐藏商人处购买，价格为400金币。环境解谜箱通常与场景机关联动，例如秘鲁丛林的宝箱需从悬崖攀绳下降至隐藏洞穴，而水下宝箱则要求玩家掌握潜水节奏与登山镐蓄力操作。
开锁器是开启大部分宝箱的基础工具，但获取时机较晚。在库阿克雅库区域，玩家需完成死亡骰子支线任务解锁隐藏商人，其位置通常出现在隐秘之城水车解密点附近。购买开锁器后，靠近锁箱会触发互动提示，长按互动键即可解锁。需注意部分宝箱被树枝或岩石遮挡，需先使用燃烧箭或炸药清除障碍。水下宝箱如灰岩坑区域的箱子，需下潜后连续按压互动键完成登山镐蓄力操作，期间要注意氧气消耗和食人鱼威胁。
秘鲁丛林坠机点附近的宝箱需从西侧潜水找到岩壁暗洞，库阿克雅库城镇旁的宝箱则需从钩锁木桩处下攀至崖壁中层左转。这类宝箱往往与独石碑谜题关联，当劳拉的方言技能达到专业等级时，独石碑文字会直接标注宝藏坐标。部分宝箱藏在古墓挑战终点，例如法官的凝视古墓需完成光线折射谜题后才能开启石棺宝箱。
靠近宝箱时会显示登山镐图标，需保持下潜状态连续快速按压互动键完成蓄力。若中途浮出水面或遭遇敌袭，蓄力进度将重置。建议优先升级潜水时长技能，并在食人鱼区域使用毒箭清除威胁。某些水下宝箱被锁链固定，需先射断连接处的绳索箭矢。宝箱内容物与游戏进度挂钩，后期开启的宝箱会产出更高级别的装备图纸。
每个区域的背包和档案地图能显示未收集的宝箱位置，库阿克雅库的背包地图藏在古墓挑战入口处，隐秘之城的档案地图则需烧毁木制路障获取。建议优先收集这些导航道具以提高效率。若遇到无法互动的宝箱，可能是因剧情进度未触发或需要特定武器解锁，不必强行破解。游戏内所有征服者宝箱均需开锁器开启，这是解锁寻宝者奖杯的必要条件。
